Дослідження проводяться на власній науково-дослідній базі, оснащеній високотехнологічним обладнанням. Інститут об’єднує мікробіологічний, фітопатологічний, ентомологічний, агрохімічний напрями досліджень. Має територію для проведення польових досліджень, мікробіологічні, мікологічні, агрохімічні лабораторії, вегетаційні кімнати, інсектарії, власний музей мікроорганізмів.